Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptbn2Q68FG2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn2Q68FG2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sptbn2Q68FG2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sptbn2Q68FG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn2Q68FG2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn2Q68FG2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sptbn2Q68FG2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sptbn2Q68FG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sptbn2Q68FG2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn2Q68FG2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn2Q68FG2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sptbn2Q68FG2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn2Q68FG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn2Q68FG2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn2Q68FG2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sptbn2Q68FG2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Sptbn2Q68FG2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sptbn2Q68FG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn2Q68FG2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn2Q68FG2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn2Q68FG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn2Q68FG2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn2Q68FG2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn2Q68FG2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn2Q68FG2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptbn2Q68FG2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sptbn2Q68FG2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn2Q68FG2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn2Q68FG2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn2Q68FG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn2Q68FG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptbn2Q68FG2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn2Q68FG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn2Q68FG2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms