Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrrc8eQ66JT1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc8eQ66JT1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lrrc8eQ66JT1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrrc8eQ66JT1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc8eQ66JT1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc8eQ66JT1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc8eQ66JT1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc8eQ66JT1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc8eQ66JT1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc8eQ66JT1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc8eQ66JT1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc8eQ66JT1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc8eQ66JT1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc8eQ66JT1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc8eQ66JT1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc8eQ66JT1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms