Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcg1Q64343 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcg1Q64343 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcg1Q64343 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcg1Q64343 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcg1Q64343 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcg1Q64343 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg1Q64343 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg1Q64343 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms