Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pan3Q640Q5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pan3Q640Q5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pan3Q640Q5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pan3Q640Q5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pan3Q640Q5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pan3Q640Q5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pan3Q640Q5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pan3Q640Q5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pan3Q640Q5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pan3Q640Q5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pan3Q640Q5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pan3Q640Q5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pan3Q640Q5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pan3Q640Q5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pan3Q640Q5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pan3Q640Q5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pan3Q640Q5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pan3Q640Q5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pan3Q640Q5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pan3Q640Q5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms