Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Vil1Q62468 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Vil1Q62468 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Vil1Q62468 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Vil1Q62468 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Vil1Q62468 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Vil1Q62468 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Vil1Q62468 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Vil1Q62468 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31,19■■■□□ 2,58
Vil1Q62468 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,17■■■□□ 2,58
Vil1Q62468 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Vil1Q62468 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Vil1Q62468 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Vil1Q62468 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Vil1Q62468 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Vil1Q62468 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Vil1Q62468 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Vil1Q62468 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Vil1Q62468 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Vil1Q62468 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Vil1Q62468 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Vil1Q62468 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Vil1Q62468 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Vil1Q62468 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Vil1Q62468 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,97■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Vil1Q62468 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Vil1Q62468 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Vil1Q62468 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Vil1Q62468 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
Vil1Q62468 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Vil1Q62468 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Vil1Q62468 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Vil1Q62468 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Vil1Q62468 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Vil1Q62468 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,83■■■□□ 2,53
Vil1Q62468 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Vil1Q62468 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Vil1Q62468 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Vil1Q62468 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Vil1Q62468 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Vil1Q62468 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Vil1Q62468 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Vil1Q62468 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Vil1Q62468 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Vil1Q62468 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Vil1Q62468 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,63■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Vil1Q62468 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Vil1Q62468 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Vil1Q62468 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Vil1Q62468 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Vil1Q62468 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Vil1Q62468 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Vil1Q62468 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Vil1Q62468 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,3 ms