Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20809Q62458 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gm20809Q62458 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm20809Q62458 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm20809Q62458 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm20809Q62458 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm20809Q62458 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm20809Q62458 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20809Q62458 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm20809Q62458 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm20809Q62458 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20809Q62458 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm20809Q62458 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20809Q62458 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm20809Q62458 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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