Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ss18Q62280 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ss18Q62280 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ss18Q62280 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ss18Q62280 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ss18Q62280 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ss18Q62280 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ss18Q62280 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ss18Q62280 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ss18Q62280 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ss18Q62280 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ss18Q62280 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ss18Q62280 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ss18Q62280 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ss18Q62280 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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