Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Odf1Q61999 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Odf1Q61999 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Odf1Q61999 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Odf1Q61999 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Odf1Q61999 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Odf1Q61999 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Odf1Q61999 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf1Q61999 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf1Q61999 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Odf1Q61999 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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