Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pacsin1Q61644 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pacsin1Q61644 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pacsin1Q61644 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pacsin1Q61644 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pacsin1Q61644 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pacsin1Q61644 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pacsin1Q61644 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pacsin1Q61644 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pacsin1Q61644 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pacsin1Q61644 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pacsin1Q61644 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Pacsin1Q61644 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pacsin1Q61644 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pacsin1Q61644 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pacsin1Q61644 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pacsin1Q61644 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pacsin1Q61644 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pacsin1Q61644 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pacsin1Q61644 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pacsin1Q61644 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pacsin1Q61644 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pacsin1Q61644 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms