Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,41■■■■□ 3,1
Erbb3Q61526 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34,37■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34,35■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34,33■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34,33■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Erbb3Q61526 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34,29■■■■□ 3,08
Erbb3Q61526 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Erbb3Q61526 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Erbb3Q61526 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Erbb3Q61526 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Erbb3Q61526 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Erbb3Q61526 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Erbb3Q61526 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
Erbb3Q61526 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Erbb3Q61526 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Erbb3Q61526 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Erbb3Q61526 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Erbb3Q61526 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Erbb3Q61526 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Erbb3Q61526 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Erbb3Q61526 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Erbb3Q61526 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Erbb3Q61526 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Erbb3Q61526 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Erbb3Q61526 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Erbb3Q61526 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34,08■■■■□ 3,05
Erbb3Q61526 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Erbb3Q61526 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Erbb3Q61526 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Erbb3Q61526 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,04
Erbb3Q61526 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Erbb3Q61526 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Erbb3Q61526 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Erbb3Q61526 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33,97■■■■□ 3,03
Erbb3Q61526 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Erbb3Q61526 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Erbb3Q61526 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
Erbb3Q61526 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33,93■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33,91■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Erbb3Q61526 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Erbb3Q61526 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Erbb3Q61526 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Erbb3Q61526 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Erbb3Q61526 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Erbb3Q61526 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Erbb3Q61526 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33,83■■■■□ 3,01
Erbb3Q61526 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3,01
Erbb3Q61526 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,79■■■■□ 3
Erbb3Q61526 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Erbb3Q61526 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Erbb3Q61526 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Erbb3Q61526 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Erbb3Q61526 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Erbb3Q61526 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,76■■■■□ 3
Erbb3Q61526 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Erbb3Q61526 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Erbb3Q61526 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Erbb3Q61526 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Erbb3Q61526 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Erbb3Q61526 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33,65■■■□□ 2,98
Erbb3Q61526 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Erbb3Q61526 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Erbb3Q61526 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Erbb3Q61526 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Erbb3Q61526 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,97
Erbb3Q61526 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,97
Erbb3Q61526 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,52■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33,51■■■□□ 2,96
Erbb3Q61526 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33,46■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Erbb3Q61526 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33,44■■■□□ 2,94
Erbb3Q61526 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,44■■■□□ 2,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms