Protein–RNA interactions for Protein: Q61493

Rev3l, DNA polymerase zeta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rev3lQ61493 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rev3lQ61493 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rev3lQ61493 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rev3lQ61493 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rev3lQ61493 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rev3lQ61493 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rev3lQ61493 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rev3lQ61493 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rev3lQ61493 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rev3lQ61493 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rev3lQ61493 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rev3lQ61493 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rev3lQ61493 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rev3lQ61493 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rev3lQ61493 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rev3lQ61493 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rev3lQ61493 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rev3lQ61493 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Rev3lQ61493 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rev3lQ61493 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rev3lQ61493 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rev3lQ61493 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rev3lQ61493 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rev3lQ61493 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rev3lQ61493 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rev3lQ61493 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rev3lQ61493 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rev3lQ61493 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rev3lQ61493 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rev3lQ61493 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rev3lQ61493 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rev3lQ61493 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rev3lQ61493 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rev3lQ61493 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rev3lQ61493 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rev3lQ61493 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rev3lQ61493 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rev3lQ61493 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rev3lQ61493 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rev3lQ61493 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rev3lQ61493 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rev3lQ61493 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rev3lQ61493 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rev3lQ61493 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms