Protein–RNA interactions for Protein: Q61205

Pafah1b3, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b3Q61205 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pafah1b3Q61205 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pafah1b3Q61205 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pafah1b3Q61205 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pafah1b3Q61205 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pafah1b3Q61205 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pafah1b3Q61205 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pafah1b3Q61205 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pafah1b3Q61205 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pafah1b3Q61205 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pafah1b3Q61205 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pafah1b3Q61205 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pafah1b3Q61205 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pafah1b3Q61205 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms