Protein–RNA interactions for Protein: Q61088

Fzd4, Frizzled-4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd4Q61088 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fzd4Q61088 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fzd4Q61088 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fzd4Q61088 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fzd4Q61088 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fzd4Q61088 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fzd4Q61088 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fzd4Q61088 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fzd4Q61088 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fzd4Q61088 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fzd4Q61088 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fzd4Q61088 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fzd4Q61088 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fzd4Q61088 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fzd4Q61088 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fzd4Q61088 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fzd4Q61088 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms