Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sim1Q61045 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sim1Q61045 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sim1Q61045 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sim1Q61045 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sim1Q61045 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sim1Q61045 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sim1Q61045 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sim1Q61045 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sim1Q61045 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sim1Q61045 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sim1Q61045 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sim1Q61045 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sim1Q61045 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sim1Q61045 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sim1Q61045 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sim1Q61045 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sim1Q61045 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sim1Q61045 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sim1Q61045 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sim1Q61045 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sim1Q61045 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sim1Q61045 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sim1Q61045 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms