Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mkrn3Q60764 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Mkrn3Q60764 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Mkrn3Q60764 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mkrn3Q60764 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mkrn3Q60764 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Mkrn3Q60764 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mkrn3Q60764 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mkrn3Q60764 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mkrn3Q60764 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Mkrn3Q60764 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mkrn3Q60764 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Mkrn3Q60764 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mkrn3Q60764 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Mkrn3Q60764 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Mkrn3Q60764 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mkrn3Q60764 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mkrn3Q60764 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mkrn3Q60764 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mkrn3Q60764 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Mkrn3Q60764 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Mkrn3Q60764 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mkrn3Q60764 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mkrn3Q60764 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mkrn3Q60764 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Mkrn3Q60764 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mkrn3Q60764 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mkrn3Q60764 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mkrn3Q60764 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mkrn3Q60764 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mkrn3Q60764 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mkrn3Q60764 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mkrn3Q60764 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mkrn3Q60764 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mkrn3Q60764 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mkrn3Q60764 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mkrn3Q60764 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mkrn3Q60764 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mkrn3Q60764 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mkrn3Q60764 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mkrn3Q60764 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms