Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ItgaeQ60677 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ItgaeQ60677 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ItgaeQ60677 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ItgaeQ60677 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ItgaeQ60677 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ItgaeQ60677 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ItgaeQ60677 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ItgaeQ60677 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ItgaeQ60677 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ItgaeQ60677 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ItgaeQ60677 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ItgaeQ60677 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ItgaeQ60677 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ItgaeQ60677 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ItgaeQ60677 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ItgaeQ60677 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ItgaeQ60677 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ItgaeQ60677 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ItgaeQ60677 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ItgaeQ60677 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ItgaeQ60677 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ItgaeQ60677 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ItgaeQ60677 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ItgaeQ60677 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ItgaeQ60677 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms