Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sema5bQ60519 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sema5bQ60519 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Sema5bQ60519 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sema5bQ60519 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sema5bQ60519 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sema5bQ60519 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sema5bQ60519 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema5bQ60519 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema5bQ60519 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema5bQ60519 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema5bQ60519 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema5bQ60519 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema5bQ60519 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema5bQ60519 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema5bQ60519 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema5bQ60519 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sema5bQ60519 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sema5bQ60519 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sema5bQ60519 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema5bQ60519 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema5bQ60519 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema5bQ60519 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sema5bQ60519 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sema5bQ60519 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema5bQ60519 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema5bQ60519 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sema5bQ60519 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema5bQ60519 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema5bQ60519 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sema5bQ60519 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sema5bQ60519 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Sema5bQ60519 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Sema5bQ60519 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sema5bQ60519 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sema5bQ60519 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sema5bQ60519 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema5bQ60519 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sema5bQ60519 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sema5bQ60519 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sema5bQ60519 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sema5bQ60519 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Sema5bQ60519 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sema5bQ60519 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sema5bQ60519 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171 ms