Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc125Q5U465 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc125Q5U465 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc125Q5U465 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc125Q5U465 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc125Q5U465 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc125Q5U465 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms