Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm12253Q5NC48 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm12253Q5NC48 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm12253Q5NC48 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm12253Q5NC48 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm12253Q5NC48 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm12253Q5NC48 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm12253Q5NC48 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm12253Q5NC48 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm12253Q5NC48 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm12253Q5NC48 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm12253Q5NC48 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm12253Q5NC48 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms