Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps41Q5KU39 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vps41Q5KU39 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vps41Q5KU39 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vps41Q5KU39 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps41Q5KU39 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps41Q5KU39 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vps41Q5KU39 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps41Q5KU39 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps41Q5KU39 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps41Q5KU39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps41Q5KU39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps41Q5KU39 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vps41Q5KU39 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps41Q5KU39 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps41Q5KU39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps41Q5KU39 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps41Q5KU39 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms