Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sfmbt2Q5DTW2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sfmbt2Q5DTW2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sfmbt2Q5DTW2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Sfmbt2Q5DTW2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt2Q5DTW2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt2Q5DTW2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sfmbt2Q5DTW2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sfmbt2Q5DTW2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sfmbt2Q5DTW2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sfmbt2Q5DTW2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sfmbt2Q5DTW2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms