Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2cd3Q52KB6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C2cd3Q52KB6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C2cd3Q52KB6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C2cd3Q52KB6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2cd3Q52KB6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2cd3Q52KB6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2cd3Q52KB6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2cd3Q52KB6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C2cd3Q52KB6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C2cd3Q52KB6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C2cd3Q52KB6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C2cd3Q52KB6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C2cd3Q52KB6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2cd3Q52KB6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2cd3Q52KB6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2cd3Q52KB6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C2cd3Q52KB6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2cd3Q52KB6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2cd3Q52KB6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C2cd3Q52KB6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C2cd3Q52KB6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C2cd3Q52KB6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms