Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZAS0

Slc9a2, Sodium/hydrogen exchanger, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a2Q3ZAS0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc9a2Q3ZAS0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc9a2Q3ZAS0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc9a2Q3ZAS0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc9a2Q3ZAS0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc9a2Q3ZAS0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc9a2Q3ZAS0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc9a2Q3ZAS0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc9a2Q3ZAS0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc9a2Q3ZAS0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc9a2Q3ZAS0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc9a2Q3ZAS0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc9a2Q3ZAS0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slc9a2Q3ZAS0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc9a2Q3ZAS0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc9a2Q3ZAS0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc9a2Q3ZAS0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc9a2Q3ZAS0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc9a2Q3ZAS0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc9a2Q3ZAS0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc9a2Q3ZAS0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc9a2Q3ZAS0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc9a2Q3ZAS0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Slc9a2Q3ZAS0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc9a2Q3ZAS0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc9a2Q3ZAS0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc9a2Q3ZAS0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc9a2Q3ZAS0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc9a2Q3ZAS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc9a2Q3ZAS0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc9a2Q3ZAS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc9a2Q3ZAS0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc9a2Q3ZAS0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Slc9a2Q3ZAS0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms