Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38,27■■■■□ 3,72
Cfap65Q3V0B4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Cfap65Q3V0B4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Cfap65Q3V0B4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Cfap65Q3V0B4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
Cfap65Q3V0B4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Cfap65Q3V0B4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Cfap65Q3V0B4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Cfap65Q3V0B4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Cfap65Q3V0B4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,15■■■■□ 3,7
Cfap65Q3V0B4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38,15■■■■□ 3,7
Cfap65Q3V0B4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Cfap65Q3V0B4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Cfap65Q3V0B4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38,13■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,11■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38,09■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Cfap65Q3V0B4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,07■■■■□ 3,68
Cfap65Q3V0B4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,68
Cfap65Q3V0B4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38,06■■■■□ 3,68
Cfap65Q3V0B4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Cfap65Q3V0B4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Cfap65Q3V0B4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Cfap65Q3V0B4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,03■■■■□ 3,68
Cfap65Q3V0B4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Cfap65Q3V0B4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Cfap65Q3V0B4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Cfap65Q3V0B4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,92■■■■□ 3,66
Cfap65Q3V0B4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37,89■■■■□ 3,66
Cfap65Q3V0B4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Cfap65Q3V0B4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Cfap65Q3V0B4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Cfap65Q3V0B4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37,85■■■■□ 3,65
Cfap65Q3V0B4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,85■■■■□ 3,65
Cfap65Q3V0B4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37,81■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,81■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37,8■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37,77■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,76■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Cfap65Q3V0B4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Cfap65Q3V0B4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Cfap65Q3V0B4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Cfap65Q3V0B4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,7■■■■□ 3,63
Cfap65Q3V0B4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Cfap65Q3V0B4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,68■■■■□ 3,62
Cfap65Q3V0B4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cfap65Q3V0B4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cfap65Q3V0B4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cfap65Q3V0B4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cfap65Q3V0B4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cfap65Q3V0B4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Cfap65Q3V0B4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,62■■■■□ 3,61
Cfap65Q3V0B4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37,62■■■■□ 3,61
Cfap65Q3V0B4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Cfap65Q3V0B4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Cfap65Q3V0B4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Cfap65Q3V0B4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37,59■■■■□ 3,61
Cfap65Q3V0B4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37,57■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,56■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37,53■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37,53■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37,52■■■■□ 3,6
Cfap65Q3V0B4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Cfap65Q3V0B4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Cfap65Q3V0B4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Cfap65Q3V0B4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Cfap65Q3V0B4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37,47■■■■□ 3,59
Cfap65Q3V0B4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37,47■■■■□ 3,59
Cfap65Q3V0B4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37,45■■■■□ 3,59
Cfap65Q3V0B4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Cfap65Q3V0B4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37,43■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,58
Cfap65Q3V0B4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Cfap65Q3V0B4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Cfap65Q3V0B4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Cfap65Q3V0B4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,35■■■■□ 3,57
Cfap65Q3V0B4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37,34■■■■□ 3,57
Cfap65Q3V0B4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Cfap65Q3V0B4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,6 ms