Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc114Q3UX62 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc114Q3UX62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc114Q3UX62 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc114Q3UX62 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc114Q3UX62 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc114Q3UX62 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc114Q3UX62 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc114Q3UX62 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc114Q3UX62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc114Q3UX62 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc114Q3UX62 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc114Q3UX62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc114Q3UX62 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc114Q3UX62 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc114Q3UX62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc114Q3UX62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc114Q3UX62 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc114Q3UX62 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc114Q3UX62 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc114Q3UX62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc114Q3UX62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc114Q3UX62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc114Q3UX62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc114Q3UX62 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc114Q3UX62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc114Q3UX62 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc114Q3UX62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc114Q3UX62 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms