Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim75Q3UWZ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim75Q3UWZ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim75Q3UWZ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim75Q3UWZ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim75Q3UWZ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim75Q3UWZ0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim75Q3UWZ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim75Q3UWZ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim75Q3UWZ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim75Q3UWZ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim75Q3UWZ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim75Q3UWZ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim75Q3UWZ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms