Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm27235Q3UW50 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27235Q3UW50 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm27235Q3UW50 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm27235Q3UW50 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm27235Q3UW50 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm27235Q3UW50 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm27235Q3UW50 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm27235Q3UW50 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm27235Q3UW50 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27235Q3UW50 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm27235Q3UW50 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm27235Q3UW50 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm27235Q3UW50 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm27235Q3UW50 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms