Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnga4Q3UW12 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cnga4Q3UW12 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnga4Q3UW12 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnga4Q3UW12 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnga4Q3UW12 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga4Q3UW12 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnga4Q3UW12 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnga4Q3UW12 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnga4Q3UW12 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms