Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcgf5Q3UK78 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcgf5Q3UK78 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf5Q3UK78 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcgf5Q3UK78 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcgf5Q3UK78 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcgf5Q3UK78 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcgf5Q3UK78 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf5Q3UK78 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcgf5Q3UK78 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcgf5Q3UK78 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcgf5Q3UK78 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcgf5Q3UK78 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcgf5Q3UK78 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcgf5Q3UK78 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcgf5Q3UK78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms