Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc61Q3UJV1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc61Q3UJV1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc61Q3UJV1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc61Q3UJV1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc61Q3UJV1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc61Q3UJV1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc61Q3UJV1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc61Q3UJV1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc61Q3UJV1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc61Q3UJV1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc61Q3UJV1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc61Q3UJV1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc61Q3UJV1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc61Q3UJV1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc61Q3UJV1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc61Q3UJV1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc61Q3UJV1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc61Q3UJV1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc61Q3UJV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc61Q3UJV1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc61Q3UJV1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc61Q3UJV1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc61Q3UJV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc61Q3UJV1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms