Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pitpnm3Q3UHE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pitpnm3Q3UHE1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pitpnm3Q3UHE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pitpnm3Q3UHE1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pitpnm3Q3UHE1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pitpnm3Q3UHE1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pitpnm3Q3UHE1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pitpnm3Q3UHE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pitpnm3Q3UHE1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pitpnm3Q3UHE1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pitpnm3Q3UHE1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms