Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm45902Q3UDN3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm45902Q3UDN3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm45902Q3UDN3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm45902Q3UDN3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm45902Q3UDN3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm45902Q3UDN3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm45902Q3UDN3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm45902Q3UDN3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm45902Q3UDN3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm45902Q3UDN3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm45902Q3UDN3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm45902Q3UDN3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm45902Q3UDN3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm45902Q3UDN3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm45902Q3UDN3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm45902Q3UDN3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm45902Q3UDN3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm45902Q3UDN3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms