Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Atxn7l3bQ3UD01 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atxn7l3bQ3UD01 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Atxn7l3bQ3UD01 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Atxn7l3bQ3UD01 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atxn7l3bQ3UD01 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Atxn7l3bQ3UD01 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Atxn7l3bQ3UD01 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Atxn7l3bQ3UD01 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atxn7l3bQ3UD01 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Atxn7l3bQ3UD01 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Atxn7l3bQ3UD01 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Atxn7l3bQ3UD01 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,13■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,1■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Atxn7l3bQ3UD01 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Atxn7l3bQ3UD01 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,9■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Atxn7l3bQ3UD01 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,57
Atxn7l3bQ3UD01 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Atxn7l3bQ3UD01 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Atxn7l3bQ3UD01 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Atxn7l3bQ3UD01 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Atxn7l3bQ3UD01 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Atxn7l3bQ3UD01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,1 ms