Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shcbp1lQ3TTP0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shcbp1lQ3TTP0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shcbp1lQ3TTP0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shcbp1lQ3TTP0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shcbp1lQ3TTP0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shcbp1lQ3TTP0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shcbp1lQ3TTP0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shcbp1lQ3TTP0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shcbp1lQ3TTP0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shcbp1lQ3TTP0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shcbp1lQ3TTP0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shcbp1lQ3TTP0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shcbp1lQ3TTP0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Shcbp1lQ3TTP0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shcbp1lQ3TTP0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shcbp1lQ3TTP0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms