Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc69Q3TCJ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc69Q3TCJ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc69Q3TCJ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc69Q3TCJ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc69Q3TCJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc69Q3TCJ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc69Q3TCJ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc69Q3TCJ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc69Q3TCJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc69Q3TCJ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc69Q3TCJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc69Q3TCJ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc69Q3TCJ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc69Q3TCJ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc69Q3TCJ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms