Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr27Q3SYJ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prr27Q3SYJ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Prr27Q3SYJ2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prr27Q3SYJ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prr27Q3SYJ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prr27Q3SYJ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prr27Q3SYJ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prr27Q3SYJ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prr27Q3SYJ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms