Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3KNL4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3KNL4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q3KNL4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q3KNL4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3KNL4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q3KNL4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q3KNL4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q3KNL4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q3KNL4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3KNL4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3KNL4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3KNL4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3KNL4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q3KNL4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3KNL4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q3KNL4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3KNL4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3KNL4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q3KNL4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q3KNL4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q3KNL4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms