Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rspo3Q2TJ95 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rspo3Q2TJ95 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rspo3Q2TJ95 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rspo3Q2TJ95 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rspo3Q2TJ95 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rspo3Q2TJ95 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rspo3Q2TJ95 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rspo3Q2TJ95 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rspo3Q2TJ95 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rspo3Q2TJ95 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rspo3Q2TJ95 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rspo3Q2TJ95 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rspo3Q2TJ95 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rspo3Q2TJ95 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rspo3Q2TJ95 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms