Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb8Q0VBD0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb8Q0VBD0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb8Q0VBD0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb8Q0VBD0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb8Q0VBD0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb8Q0VBD0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb8Q0VBD0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb8Q0VBD0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb8Q0VBD0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb8Q0VBD0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb8Q0VBD0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb8Q0VBD0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Itgb8Q0VBD0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb8Q0VBD0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb8Q0VBD0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb8Q0VBD0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb8Q0VBD0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb8Q0VBD0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb8Q0VBD0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb8Q0VBD0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb8Q0VBD0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb8Q0VBD0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms