Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab42Q0PD08 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab42Q0PD08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab42Q0PD08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab42Q0PD08 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab42Q0PD08 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab42Q0PD08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab42Q0PD08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab42Q0PD08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab42Q0PD08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab42Q0PD08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab42Q0PD08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab42Q0PD08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab42Q0PD08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab42Q0PD08 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab42Q0PD08 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab42Q0PD08 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab42Q0PD08 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab42Q0PD08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab42Q0PD08 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms