Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Vps8Q0P5W1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Vps8Q0P5W1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Vps8Q0P5W1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Vps8Q0P5W1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Vps8Q0P5W1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Vps8Q0P5W1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Vps8Q0P5W1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Vps8Q0P5W1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Vps8Q0P5W1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Vps8Q0P5W1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Vps8Q0P5W1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Vps8Q0P5W1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Vps8Q0P5W1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Vps8Q0P5W1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Vps8Q0P5W1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Vps8Q0P5W1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Vps8Q0P5W1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Vps8Q0P5W1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Vps8Q0P5W1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Vps8Q0P5W1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Vps8Q0P5W1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Vps8Q0P5W1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Vps8Q0P5W1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Vps8Q0P5W1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Vps8Q0P5W1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Vps8Q0P5W1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Vps8Q0P5W1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Vps8Q0P5W1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Vps8Q0P5W1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Vps8Q0P5W1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Vps8Q0P5W1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Vps8Q0P5W1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Vps8Q0P5W1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Vps8Q0P5W1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Vps8Q0P5W1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Vps8Q0P5W1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Vps8Q0P5W1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Vps8Q0P5W1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Vps8Q0P5W1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Vps8Q0P5W1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Vps8Q0P5W1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Vps8Q0P5W1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Vps8Q0P5W1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Vps8Q0P5W1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Vps8Q0P5W1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Vps8Q0P5W1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Vps8Q0P5W1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Vps8Q0P5W1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Vps8Q0P5W1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Vps8Q0P5W1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Vps8Q0P5W1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Vps8Q0P5W1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Vps8Q0P5W1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Vps8Q0P5W1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Vps8Q0P5W1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Vps8Q0P5W1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Vps8Q0P5W1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Vps8Q0P5W1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Vps8Q0P5W1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Vps8Q0P5W1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Vps8Q0P5W1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Vps8Q0P5W1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Vps8Q0P5W1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Vps8Q0P5W1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Vps8Q0P5W1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Vps8Q0P5W1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Vps8Q0P5W1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Vps8Q0P5W1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Vps8Q0P5W1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Vps8Q0P5W1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Vps8Q0P5W1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Vps8Q0P5W1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Vps8Q0P5W1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Vps8Q0P5W1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Vps8Q0P5W1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Vps8Q0P5W1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Vps8Q0P5W1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Vps8Q0P5W1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Vps8Q0P5W1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Vps8Q0P5W1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Vps8Q0P5W1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Vps8Q0P5W1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Vps8Q0P5W1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Vps8Q0P5W1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Vps8Q0P5W1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Vps8Q0P5W1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Vps8Q0P5W1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Vps8Q0P5W1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Vps8Q0P5W1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Vps8Q0P5W1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Vps8Q0P5W1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Vps8Q0P5W1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Vps8Q0P5W1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Vps8Q0P5W1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Vps8Q0P5W1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Vps8Q0P5W1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms