Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp2Q08652 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp2Q08652 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbp2Q08652 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbp2Q08652 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp2Q08652 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp2Q08652 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp2Q08652 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rbp2Q08652 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp2Q08652 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms