Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Apoc2Q05020 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoc2Q05020 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apoc2Q05020 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoc2Q05020 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoc2Q05020 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoc2Q05020 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoc2Q05020 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoc2Q05020 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoc2Q05020 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoc2Q05020 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoc2Q05020 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoc2Q05020 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoc2Q05020 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms