Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk16Q04735 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk16Q04735 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk16Q04735 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk16Q04735 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk16Q04735 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdk16Q04735 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk16Q04735 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk16Q04735 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk16Q04735 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk16Q04735 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk16Q04735 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk16Q04735 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk16Q04735 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk16Q04735 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk16Q04735 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk16Q04735 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk16Q04735 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms