Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VcpQ01853 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VcpQ01853 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VcpQ01853 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VcpQ01853 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VcpQ01853 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VcpQ01853 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VcpQ01853 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VcpQ01853 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VcpQ01853 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VcpQ01853 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VcpQ01853 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VcpQ01853 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VcpQ01853 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VcpQ01853 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VcpQ01853 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VcpQ01853 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VcpQ01853 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VcpQ01853 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VcpQ01853 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VcpQ01853 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VcpQ01853 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VcpQ01853 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VcpQ01853 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VcpQ01853 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VcpQ01853 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VcpQ01853 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VcpQ01853 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VcpQ01853 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VcpQ01853 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VcpQ01853 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VcpQ01853 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VcpQ01853 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VcpQ01853 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VcpQ01853 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VcpQ01853 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VcpQ01853 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VcpQ01853 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VcpQ01853 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VcpQ01853 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VcpQ01853 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VcpQ01853 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VcpQ01853 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VcpQ01853 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VcpQ01853 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VcpQ01853 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms