Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna1cQ01815 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna1cQ01815 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cacna1cQ01815 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna1cQ01815 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1cQ01815 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1cQ01815 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1cQ01815 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1cQ01815 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1cQ01815 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1cQ01815 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1cQ01815 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1cQ01815 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1cQ01815 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacna1cQ01815 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacna1cQ01815 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacna1cQ01815 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 498.3 ms