Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp4Q00724 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbp4Q00724 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbp4Q00724 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbp4Q00724 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp4Q00724 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp4Q00724 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rbp4Q00724 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rbp4Q00724 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rbp4Q00724 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rbp4Q00724 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms