Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apoa1Q00623 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apoa1Q00623 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apoa1Q00623 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apoa1Q00623 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoa1Q00623 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Apoa1Q00623 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Apoa1Q00623 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apoa1Q00623 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa1Q00623 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoa1Q00623 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoa1Q00623 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apoa1Q00623 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa1Q00623 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoa1Q00623 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apoa1Q00623 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms