Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HmmrQ00547 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HmmrQ00547 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HmmrQ00547 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HmmrQ00547 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HmmrQ00547 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HmmrQ00547 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HmmrQ00547 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HmmrQ00547 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HmmrQ00547 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HmmrQ00547 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HmmrQ00547 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HmmrQ00547 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HmmrQ00547 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HmmrQ00547 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HmmrQ00547 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HmmrQ00547 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HmmrQ00547 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HmmrQ00547 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HmmrQ00547 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HmmrQ00547 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HmmrQ00547 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms