Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx2Q00262 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx2Q00262 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx2Q00262 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx2Q00262 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx2Q00262 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Stx2Q00262 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx2Q00262 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stx2Q00262 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx2Q00262 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx2Q00262 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx2Q00262 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx2Q00262 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx2Q00262 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx2Q00262 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stx2Q00262 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Stx2Q00262 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stx2Q00262 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stx2Q00262 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stx2Q00262 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx2Q00262 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx2Q00262 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx2Q00262 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stx2Q00262 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stx2Q00262 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stx2Q00262 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stx2Q00262 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stx2Q00262 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms